苑玲玲
苑玲玲,博士,2014年畢業(yè)于University of Nebraska-Lincoln,專業(yè)為Plant Breeding and Genetics。同年,加入LI-COR公司環(huán)境部,現(xiàn)為資深應(yīng)用科學(xué)家。
你用400 ppm min-1來(lái)Ramp,就意味著做整條A-Ci曲線(例如從10ppm-1600ppm),只需要4min,這就大大縮短了測(cè)量時(shí)間【考慮到種內(nèi)和種間差異,具體Ramp參數(shù)設(shè)置,請(qǐng)通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定】。新技術(shù)顯著縮短了測(cè)量耗時(shí),大大提升了測(cè)量效率。
新技術(shù)和傳統(tǒng)方法得到的Vcmax、Jmax和二氧化碳補(bǔ)償點(diǎn)吻合度高。但是,傳統(tǒng)方法測(cè)量得到的原始數(shù)據(jù)點(diǎn)少,曲線擬合出來(lái)的參數(shù)具有更大的不確定性。除了A-Ci曲線,這項(xiàng)新技術(shù)也在調(diào)查類測(cè)量(Survey Measurement)和光響應(yīng)曲線測(cè)量(A-Q Curve)方面做了驗(yàn)證。
LI-COR 苑玲玲:LI-6800測(cè)量新技術(shù)DAT.mp3
A new technique for gas exchange measurements: Dynamic AssimilationTM
2021.10.16 武漢
各位老師同學(xué),大家好!今天給大家介紹一項(xiàng)用于葉片氣體交換測(cè)量的新技術(shù)。
叫做Dynamic AssimilationTM,或者是叫Dynamic AssimilationTM Technique。首字母的縮寫(xiě)就是DAT(動(dòng)態(tài)吸收測(cè)量技術(shù))。
首先我們簡(jiǎn)要回顧一下氣體交換測(cè)量的歷史,之后我會(huì)給大家介紹目前所使用的測(cè)量技術(shù),然后我會(huì)重點(diǎn)談一下DAT。
世界人口的急劇增長(zhǎng)使得人們對(duì)于糧食和能源的要求不斷增大,這就刺激了光合作用的研究。而對(duì)于光合作用研究的需求,又推動(dòng)了相關(guān)儀器和測(cè)量技術(shù)的發(fā)展。
回顧歷史,100年前,大約是在1920年左右的時(shí)候,研究人員通過(guò)化學(xué)試劑滴定的方法來(lái)測(cè)量葉片對(duì)于CO2的吸收,作為評(píng)估葉片光合能力的指標(biāo)。核心原理就是利用CO2與氫氧化鋇產(chǎn)生碳酸鋇沉淀,然后用酸來(lái)滴定中和,通過(guò)對(duì)比空白組所需酸的量的差別來(lái)計(jì)算葉片對(duì)于CO2的吸收。
人工搭建的這個(gè)設(shè)備,大家可以看到這張圖,操作起來(lái)費(fèi)時(shí)費(fèi)力,這張圖顯示了當(dāng)時(shí)所用的設(shè)備。圖片出自下面這篇paper,引用過(guò)來(lái)的。這張圖顯示的就是通過(guò)這種滴定方法測(cè)得的一天中甘蔗葉片對(duì)于CO2吸收的日變化。
到了上個(gè)世紀(jì)四五十年代,紅外線氣體分析儀逐漸發(fā)展了起來(lái),人們便開(kāi)始把這個(gè)紅外線氣體分析儀用在光合測(cè)量設(shè)備里面。
當(dāng)時(shí)很多設(shè)備因?yàn)轶w積龐大、操作繁瑣,基本只能在室內(nèi)使用。但是因?yàn)榇蠹覍?duì)戶外測(cè)量是很有需求的,所以一些可移動(dòng)的設(shè)備也被研發(fā)出來(lái),如像這個(gè)Slide右手邊這種。
到了上個(gè)世紀(jì)八十年代、九十年代的時(shí)候,LI-COR公司研發(fā)的LI-6200、LI-6400相繼問(wèn)世,可以說(shuō)是拎起來(lái)就走,之后更先進(jìn)的LI-6800問(wèn)世,那就更方便了,操作直觀,自動(dòng)化控制。
回顧歷史,我們可以看到,人們對(duì)于光合測(cè)量設(shè)備的不斷追求,為光合研究提供了新工具。
現(xiàn)在市面上的氣體交換測(cè)量系統(tǒng),一般都是采用開(kāi)路式的方法、開(kāi)放式氣路(進(jìn)行測(cè)量)。
所謂開(kāi)放式氣路,顧名思義是指非封閉。氣流持續(xù)的有進(jìn)有出。對(duì)LI-6800來(lái)說(shuō),外界的空氣進(jìn)入主機(jī),水汽、CO2濃度被調(diào)適以后,出來(lái),進(jìn)入分析器。分流,一路不接觸葉片直接被測(cè)量,叫做Reference,作為對(duì)照。另外一路經(jīng)過(guò)葉片,然后被測(cè)量,叫做Sample,最后氣流排到外界。Anyway,就是說(shuō)氣流有進(jìn)有出,這是一個(gè)開(kāi)放式氣路。那么在葉片所在的這個(gè)位置,就是葉室這個(gè)地方,具體發(fā)生了什么呢?
這個(gè)長(zhǎng)方形代表整個(gè)葉室部分,氣流流經(jīng)葉室,進(jìn)氣流速為u1,進(jìn)氣流中CO2濃度為c1,水汽濃度為w1,出葉室的CO2濃度c2,水汽濃度w2,這些指標(biāo)都會(huì)被儀器直接測(cè)量記錄。由于葉片的光合作用吸收CO2,蒸騰作用釋放水汽,這就是所謂的氣體交換,使得c1和c2之間,w1和w2之間存在差值,這個(gè)差值用于計(jì)算CO2同化速率和蒸騰速率。
在這個(gè)公式里,A代表CO2同化速率,E代表蒸騰速率,s代表葉面積。基于對(duì)這個(gè)氣流水汽和CO2濃度的測(cè)量,蒸騰速率和CO2同化速率就用這兩個(gè)公式計(jì)算出來(lái)。這里需要注意的一點(diǎn)是,這兩個(gè)公式是基于“Steady State",或者說(shuō)是穩(wěn)定狀態(tài)。長(zhǎng)久以來(lái),開(kāi)路式氣體交換測(cè)量,都是依賴于“Steady State"。
那你可能要問(wèn)了,什么叫“Steady State"呢?它是指葉室情況穩(wěn)定,達(dá)到一個(gè)穩(wěn)定狀態(tài),就是說(shuō)CO2,c1和c2達(dá)到一個(gè)恒定值,水汽w1和w2達(dá)到一個(gè)恒定值,氣流u1和u2也要達(dá)到一個(gè)恒定狀態(tài)。
一旦不穩(wěn)定,用這個(gè)公式計(jì)算出來(lái)的CO2同化速率就是不對(duì)的了。比如說(shuō),當(dāng)葉室是空的、關(guān)閉的,沒(méi)有葉片的時(shí)候,測(cè)得的CO2的同化速率應(yīng)該是零,對(duì)吧。因?yàn)闆](méi)有葉片,不管你的CO2濃度控制是多少,或者怎樣變化,光合值應(yīng)該都為零,但是市面上光合儀的表現(xiàn),卻不是這樣。
大家會(huì)經(jīng)常注意到,如果你改變CO2濃度,比如像左邊這張圖,CO2控制從400ppm到600ppm,您能看到光合值突然有很大的波動(dòng),然后再逐漸的回歸到零。
這就意味著,在記錄數(shù)據(jù)的時(shí)候,你需要等待,需要等待葉室又重新達(dá)到一個(gè)新的Steady State后,才能記錄數(shù)據(jù)。大家能看到,這兩張圖中,前30秒的階段是一個(gè)Steady state,大概70s以后,也是一個(gè)Steady state,從30s到70s之間,是一個(gè)Non-steady state,就是一個(gè)非穩(wěn)定狀態(tài)。
如果您在Non-steady state階段記錄數(shù)據(jù),那您的數(shù)據(jù)就是不對(duì)的。
那有沒(méi)有一個(gè)方法可以實(shí)現(xiàn)更快的氣體交換測(cè)量呢?
幾年前,LI-COR聯(lián)合The University of New Mexico的研究人員,推出了一項(xiàng)新技術(shù)叫做RACiRTM,RACiRTM用于CO2響應(yīng)曲線的測(cè)量。它是通過(guò)Ramp CO2濃度(連續(xù)降低或升高CO2的濃度),像左邊這張圖,之后通過(guò)空葉室校正來(lái)得到最終的數(shù)據(jù)。RACiRTM讓使用者可以更快的測(cè)量A-Ci曲線,進(jìn)而得到Vcmax等參數(shù),這讓快速篩選成為可能。
另外由于CO2是連續(xù)變化的,儀器在連續(xù)的快速記錄數(shù)據(jù),因此能獲得大量的數(shù)據(jù)點(diǎn)。大量的數(shù)據(jù)點(diǎn),對(duì)于A-Ci曲線的擬合是大有幫助的。但RACiRTM是有局限性的,只能用于A-Ci曲線的測(cè)量,不能用于其他類型的測(cè)量,如調(diào)查式測(cè)量(Survey Measurement)或光響應(yīng)曲線的測(cè)量(A-Q Curve)。
另外RACiRTM所用的這個(gè)CO2 Ramp Rate,不能太快,局限于100ppm/min。另外RACiRTM需要空葉室校正過(guò)程。測(cè)量數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性,依賴于空葉室校正的數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性。
那有沒(méi)有一項(xiàng)技術(shù),可以突破RACiRTM的這種局限呢?比如說(shuō)CO2 Ramp rate能不能更快一些? 除了A-Ci曲線的測(cè)量,可不可以應(yīng)用到其他類型的測(cè)量上呢?
下面我就用一些Slides,來(lái)講一講由LI-COR研發(fā)并成功應(yīng)用到LI-6800的這項(xiàng)新技術(shù)。
其實(shí)對(duì)于開(kāi)放式測(cè)量系統(tǒng),它的Fundamental質(zhì)量平衡公式是這個(gè),相比之前的Slide,這個(gè)公式里多了一項(xiàng),就是這個(gè)dc/dt。這個(gè)公式很好理解,這個(gè)u1c1,代表了有多少CO2進(jìn)入了葉室,u2c2是多少CO2離開(kāi)了葉室,SA這一項(xiàng)是多少CO2被吸收,這個(gè)dc/dt就是葉室內(nèi)的CO2濃度隨時(shí)間的變化。
在Steady State的情況下,dc/dt為零。就是說(shuō)葉室內(nèi)的CO2濃度隨時(shí)間是不變的。當(dāng)dc/dt=0時(shí),通過(guò)推導(dǎo),你能看到這個(gè)A值,就是在Steady State下使用的公式。
所以,Steady State下使用的公式是Fundamental質(zhì)量平衡方程的一種特殊狀態(tài),即dc/dt=0。
那么不在Steady State的情況下,或者說(shuō)dc/dt不等于0的情況下,這個(gè)等式就是一個(gè)Dynamic質(zhì)量平衡方程。在這種情況下,你把A值推導(dǎo)出來(lái),就是右邊這個(gè)公式。這個(gè)公式可以說(shuō)是Dynamic AssimilationTM Technique(動(dòng)態(tài)吸收測(cè)量技術(shù))的核心公式。
因?yàn)長(zhǎng)I-6800的*性,比如說(shuō),快速精準(zhǔn)連續(xù)的環(huán)境條件控制、葉室緊靠分析儀,以及Range Match功能,使得Dynamic AssimilationTM Technique(動(dòng)態(tài)吸收測(cè)量技術(shù))這項(xiàng)新技術(shù)可以整合進(jìn)LI-6800系統(tǒng)。
經(jīng)驗(yàn)證,這項(xiàng)新技術(shù)優(yōu)于傳統(tǒng)的Steady State的測(cè)量方法以及RACiRTM。
我們做空葉室實(shí)驗(yàn),就是用關(guān)閉的空葉室,CO2的同化速率A應(yīng)該為零。當(dāng)CO2濃度改變后,比如CO2濃度從400ppm提升到600ppm,基于Steady State的技術(shù)測(cè)量的數(shù)據(jù)點(diǎn)是右圖中紅色的Curve,能看到,CO2同化速率A會(huì)有一個(gè)大的波動(dòng),等待一段時(shí)間(約40s)后,才會(huì)重新回到零。
基于這項(xiàng)新技術(shù),CO2同化速率A,也就是這個(gè)藍(lán)色的Curve,只有一個(gè)小小的波動(dòng),并且很快(約5s)就回到了零。這意味著,在測(cè)量葉片的時(shí)候,等待的時(shí)間會(huì)大幅減少。
這張Slide,同樣是空葉室實(shí)驗(yàn),沒(méi)有葉片,CO2濃度從0ppm改變到1600ppm,連續(xù)變化的整個(gè)過(guò)程中,大家看到,這個(gè)藍(lán)色的Curve,是使用新技術(shù)Dynamic AssimilationTM Technique(動(dòng)態(tài)吸收測(cè)量技術(shù))測(cè)量得到的凈光合速率A,整個(gè)過(guò)程一直保持在0附近。但是傳統(tǒng)的測(cè)量方法,A值會(huì)有很長(zhǎng)一段時(shí)間(約500s)的升高,當(dāng)CO2穩(wěn)定以后,傳統(tǒng)測(cè)量方法得到的A值才會(huì)重新回到0。
除了在空葉室的驗(yàn)證,以下這些Slides通過(guò)真實(shí)的測(cè)量葉片來(lái)驗(yàn)證這項(xiàng)新技術(shù)的優(yōu)勢(shì)。
下面左邊這張圖比對(duì)了三種不同的方法,做的A-Ci響應(yīng)曲線,其中,藍(lán)色、紅色代表是Dynamic AssimilationTM Technique(動(dòng)態(tài)吸收測(cè)量技術(shù)),黃色代表的是RACiRTM,紫色的方塊和紅色的×是傳統(tǒng)方法所測(cè)量的A-Ci響應(yīng)曲線。大家能看到這些結(jié)果是基本吻合的,DAT #1和#2有什么區(qū)別呢?CO2 Ramp速率是不一樣的,#1是200ppm/min, #2是400ppm/min。實(shí)驗(yàn)樣品是向日葵葉片。大家可以看到,對(duì)于向日葵葉片來(lái)說(shuō),兩個(gè)Ramp速率,結(jié)果差別很小。
你用400ppm/min來(lái)Ramp,就意味著做整條A-Ci曲線(10ppm-1600ppm),只需要4min,這就大大縮短了測(cè)量時(shí)間。傳統(tǒng)測(cè)量方法,一條A-Ci響應(yīng)曲線需要~30min。右邊這張圖就是Curve起始階段放大后的圖,大家可以看到,新技術(shù)和傳統(tǒng)方法得到Vcmax、Jmax和二氧化碳補(bǔ)償點(diǎn)是基本吻合的。但是,傳統(tǒng)方法測(cè)量得到的數(shù)據(jù)點(diǎn)少,曲線出來(lái)的參數(shù)具有更高的不確定性。那除了A-Ci曲線,這項(xiàng)新技術(shù)也在調(diào)查類測(cè)量方面做了驗(yàn)證,并且有明顯的優(yōu)勢(shì)。
下面這個(gè)實(shí)驗(yàn)是調(diào)查式測(cè)量,一開(kāi)始這個(gè)葉室為關(guān)閉狀態(tài),空葉室CO2R和CO2S都是穩(wěn)定的,起始階段CO2同化速率A也是穩(wěn)定的。然后在這個(gè)時(shí)間點(diǎn),葉室被打開(kāi),打開(kāi)以后夾上葉片,關(guān)閉葉室,葉片之前做過(guò)光適應(yīng),藍(lán)線是用新技術(shù)測(cè)量得到的CO2同化速率,紅色是傳統(tǒng)方法測(cè)量得到的CO2同化速率,可以明顯的看到,這個(gè)新技術(shù)回到穩(wěn)定狀態(tài)更快。最右邊這張圖就是畫(huà)圈部分的放大圖,傳統(tǒng)方法滯后約20-30s。
另外,這項(xiàng)新技術(shù)也能用于光響應(yīng)曲線(A-Q Curve)的測(cè)量。由于植物響應(yīng)光強(qiáng)變化要慢于CO2的變化,使用這項(xiàng)新技術(shù)做光響應(yīng)曲線測(cè)量時(shí),光強(qiáng)的Ramp rate不能太快,因此完成光響應(yīng)曲線所需要的時(shí)間與傳統(tǒng)的常規(guī)方法是接近的。新技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)是數(shù)據(jù)點(diǎn)多,有助于更準(zhǔn)確的曲線擬合。
總結(jié)一下,Dynamic AssimilationTM(動(dòng)態(tài)吸收測(cè)量技術(shù))在三種重要的測(cè)量類型中,都可以應(yīng)用,尤其是在A-Ci曲線測(cè)量和調(diào)查類測(cè)量中,新技術(shù)顯著提高了測(cè)量速度,密集的數(shù)據(jù)點(diǎn)有助于曲線擬合;在光響應(yīng)曲線(A-Q Curve)的測(cè)量中,優(yōu)勢(shì)體現(xiàn)在密集的數(shù)據(jù)采樣上。
這項(xiàng)新技術(shù)是由LI-COR的兩位科學(xué)家Aaron J Saathoff和Jon Welles共同開(kāi)發(fā),并成功整合應(yīng)用到了LI-6800里面。關(guān)于這項(xiàng)新技術(shù)的文章,兩個(gè)月前發(fā)表在Plant Cell& Environment雜志上,題目是Gas exchange measurements in the unsteady state(doi.org/10.1111/pce.14178)。這篇文章是Open Access的,大家感興趣的可以找來(lái)讀一下。好,今天我的報(bào)告就到這里,謝謝大家。
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